一、Rubicon和Qiagen单细胞全基因组扩增试剂盒的对比
品牌 | Rubicon | Qiagen |
产品 | PicoPLEX WGA Kit 单细胞全基因组扩增试剂盒 | REPLI-g Single Cell Kit 单细胞全基因组扩增试剂盒 |
技术 | 特殊随机引物起始的热循环扩增+PCR | 多重置换扩增(MDA) |
表现 | 中等基因组覆盖度 中等保真度 低基因丢失率 zui高的重复性和一致性 | 高基因组覆盖度 高保真度 高基因丢失率 低重复性和一致性 |
*应用 | 基因拷贝数变异 (CNV) | 单核苷酸变异(SNV) |
操作细节 |
反应时间 | 3小时 | 超过8小时 |
扩增DNA产量 | 2-5µg2 | 7-20 µg1,40µg3 |
产物长度 | 0.25–1.0 kb1 | 平均长度 >10 kb3 |
参考:
1.The comparison of the performance of four whole genome amplification kits on ion proton platform in copy number variation detection. Xinyi Zhang et al.
2.Rubicon 资料,RB3050说明书.
3.Qiagen 资料,150343说明书.
二、产品介绍
Rubicon PicoPLEX WGA Kit单细胞全基因组扩增试剂盒
单管,3步,PicoPlEX WGA试剂盒专门用于人单细胞和pg级DNA的扩增,具有可重复性、低背景的特点。3小时内完成细胞裂解、热循环文库制备和低背景扩增,zui终能得到2-5µg扩增DNA。
技术原理及特点
利用特殊随机引物(Quasi-random primer)引发线性扩增进行全基因组扩增。
相比于以往的PCR、MDA、MALBC为基础的单细胞全基因组扩增技术,操作简单快速。扩增zui大优势:再现性良好。
REPLI-g Single Cell Kit 单细胞扩增试剂盒
REPLI-g Single Cell Kit 单细胞扩增试剂盒采用MDA技术,可均一的扩增单个细胞(1至1000个细菌或肿瘤细胞)或纯化的基因组DNA,能够覆盖基因组所有位点。产量稳定,可达40 µg(产物平均长度大于>10 kb)。适用于二代测序等新技术应用。可用于癌症、干细胞或宏观基因组学(metagenomics)研究。
技术原理及特点
REPLI-g Single Cell Kit 单细胞扩增试剂盒采用多重置换扩增(MDA,Multiple Displacement Amplification)技术,对所有基因组位点进行无偏差的扩增。与基于PCR的全基因组扩增技术相比,该技术具有更好的扩增保真度,避免出现假阳性或假阴性信号。
多重置换扩增(MDA)的恒温基因组扩增技术包含了随机六聚体与变性DNA的结合过程,以及使用Phi 29聚合酶在恒定温度下进行的链置换合成过程。典型扩增能够生成40 µg以上的DNA产量,而不受起始模板量影响,这意味着在大多数应用中无需进行额外的DNA浓度检测,既可直接进行后续的遗传学分析。
温和的碱变性法
REPLI-g Kit采用温和碱性孵育法,在DNA断裂或去碱基化发生频率非常低的情况下让使其均匀地变性。这样扩增得到的DNA具有非常高的完整性,扩增片段的长度达到zui大化,从而使基因组中的位点和序列都得以均匀呈递。
订购信息
品牌 | 货号 | 产品名称 | 包装 |
Rubicon | RB3050/R30050 | PicoPLEX WGA Kit单细胞全基因组扩增试剂盒,array CGH、PCR分析用 | 50次反应 |
QIAGEN | 150343 | REPLI-g Single Cell Kit 单细胞全基因组扩增试剂盒 | 24次/盒 |
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