服务热线

15021010459
技术文章
当前位置:主页 > 技术文章 > Takara真香推荐—简便好用的液态活检解决方案之游离DNA篇

Takara真香推荐—简便好用的液态活检解决方案之游离DNA篇

更新时间:2020-10-12 点击次数:1156
 
 
在肿瘤早期筛查研究领域,循环肿瘤DNA(ctDNA)一直是各大厂商、科研工作者关注的重点。虽然ctDNA的应用日趋成熟,但总有一些微量的ctDNA样本无法用传统技术完成高品质文库的构建,特别是在进行肿瘤早期诊断有重要价值的稀有突变分析时。
如何以微量ctDNA起始构建可准确分析稀有突变的文库?Takara的解决方案是引入分子标签技术!
 
微量ctDNA样本无法准确分析稀有变异? 自带1600万分子标签的建库技术了解一下
ThruPLEX Tag-Seq Kit是Takara推出的采用茎环形接头,含1600万种分子标签的DNA-Seq文库构建技术,足以准确区分是测序错误还是真实的稀有突变!
 
同时,该产品支持1-50 ng cfDNA起始,微量样本的文库构建不再是难题!
ThruPLEX单管操作、手动15 min、总共两小时,过程中无需转管与纯化,实验小白也能轻松上手!
 
 
实验案例
 
分别以10 ng及30 ng的cfDNA标准样品(Horizon Diagnostics)起始,使用ThruPLEX Tag-seq kit制备文库,然后使用Agilent SureSelect靶向序列富集系统定制Panel(110 KB),或Roche的NimbleGen SeqCap EZ定制Panel(240 KB)进行富集,使用illumina的NGS平台进行测序。得到的数据使用Curio(Curio Genomics)分析。
使用Agilent (30 ng DNA input)或Roche(10 ng DNA input)两者中的任意一个靶向富集系统时,可以得到与已知的MAF(Minor Allele Frequency)同等的结果。
(数据来源于Takara Bio USA, Inc.)
 
加量不加价,白送的知识点与讲座,还不赶快Get?
 
实验友好型的ctDNA稀有突变分析方案
可能有些刚开展ctDNA稀有变异分析项目的朋友会有所担心,即便能简便快捷地构建NGS文库,但后期如果没有易用的生信分析流程,一样会成为项目研发的阻碍。
No Worries!以下三款生信分析工具,搭配ThruPLEX Tag-Seq使用,效果更佳!

ConnorGitHub平台上一款开放型的生信工具,可以处理ThruPLEX Tag-Seq文库的测序数据。Connor可以aligned BAM文件作为输入量,分析分子标签信息,并生成含对应序列的BAM文件,后续可结合突变分析软件进行分析,如FreeBayes等。
CurioCurio Genomics公司所推出的基于“云”的生信平台,ThruPLEX Tag-Seq文库的测序数据可以上传、处理及可视化。该平台运行速度快,用户界面友好,具有强大的Alignment Viewer。同时,Curio整合了变异检测、分析及可视化的模块,方便用户使用。
Strand NGS由Strand Life Sciences推出的原生支持ThruPLEX Tag-Seq数据分析的生信平台,提供NGS数据的分析、管理及可视化。

 

 重庆市华雅干细胞技术有限公司拥有takara旗下Clontech代理商,正品现货,欢迎咨询!

 

2024 版权所有 © 重庆市华雅干细胞技术有限公司  备案号:渝ICP备14000349号-4 sitemap.xml 管理登陆 技术支持:化工仪器网

地址:重庆市江北区金渝大道153号8栋20-14 传真:023-63419626 邮件:sales@ys-bio.com

重庆市华雅干细胞技术有限公司主要经营干细胞研究 干细胞治疗产品 生物试剂 实验耗材 药物研发等产品。

关注我们

服务热线

400-021-2200

扫一扫,关注我们

Baidu
map