当ThruPLEX技术遇上FFPE样本，会带来怎样的“*操作”！

Formalin Fixed and Paraffin Embedded

FFPE样本作为生物和医学领域的重要样本来源，广受研究者的青睐。由于样本固定和储存过程中，容易发生核酸的降解和损伤，因此获得符合测序质量要求的文库通常很具有挑战性。那么面对做DNA-Seq的FFPE样本，应该如何应对呢？

“想要随心所欲的进行FFPE-DNA样本文库构建”，
这个神器值得拥有

【SMARTer ThruPLEX DNA-Seq Kit】

“飞一般感觉”的操作

FFPE样本珍贵，担心在文库制备时损失？选择它吧。

该试剂盒利用ThruPLEX技术，通过使用特殊的茎环形接头，实现了更加简洁高效的实验流程和更短时间的手动操作。从起始DNA样本到可用于上机测序的文库仅需要三步2小时的操作。特别需要说明的是，整个操作是在一个反应管中即可完成，中间不需要纯化，能很大程度的减少样本的污染和损失！

技术概要：

(图片来源于Takara Bio Inc.)

“*”的文库质量

FFPE样本降解严重，害怕不能得到高质量文库？选择它吧。

Takara严谨的数据评测：使用100 ng的FFPE-DNA样品，分别使用本试剂盒、A公司试剂盒和B公司试剂盒制备文库，然后使用Illumina NextSeq 500（2×76bp）测序分析。相比于其他公司试剂盒，以FFPE样品起始时，使用本试剂盒可以获得多样性更好的文库。另外，使用本试剂盒制备的文库，在不同GC含量范围内可以产生更均匀的覆盖分布。

(数据来源于Takara Bio Inc.)

“经得起检验”-文献引用加持

说得好不如做得好，应用文献的真实反馈可供参考，选择它吧。

2018年7月20日发表在《npj Genomic Medicine》题为Recurrent loss of heterozygosity correlates with clinical outcome in pancreatic neuroendocrine cancer的文章。本研究利用全基因组测序技术（WGS）分析了胰腺神经内分泌瘤的拷贝数变异情况，结果表明，胰腺神经内分泌肿瘤的染色体杂合性的缺失与临床预后相关。实验以3-50 ng的微量FFPE-DNA样本起始，使用ThruPLEX-FD Kit（现为ThruPLEX DNA-Seq Kit）制备文库，并通过WGS与微阵列结果来验证拷贝数变异（CNV）。

以上内容都佐证了以降解样本起始时，使用该试剂盒可以得到高品质的文库！

所以，恰好您要用FFPE样本进行基因组分析，恰好我有SMARTer ThruPLEX DNA-Seq Kit。世间好物虽多，但它值得尝试！

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