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KAPA RiboErase Globin 血液RNA-Seq的利器

更新时间:2021-02-04 点击次数:1905

 

对血液样本进行RNA测序时,如果不进行适当的处理,会影响测序的结果。

 
 

*,真核生物细胞含有一些高丰度RNA,其中含量高的是核糖体RNA(rRNA),而血液的RNA中含量第二高的就是珠蛋白(globin)RNA。这两种RNA占血液样本总RNA的85%以上

 

如果不进行处理就建库测序,高丰度RNA占据着大量的数据,不仅浪费了测序成本,更淹没了目标RNA的数据,特别是一些低丰度但起着关键调控的RNA或者是罕见融合位点,使我们难以比较表达的差异化和特异性。

 

利用mRNA的polyA尾特点来富集mRNA的方法,虽然可以去除核糖体RNA,但并不能去除globin mRNA,同时其它的非编码RNA的品种也会一并丢失。另外,在RNA样本的质量不高时,由于降解导致polyA尾的不完整,这种方法也不适用。

 
 
 

这些问题通过采用RNA酶H法的KAPA新品Globin RNA去除寡核苷酸加上RiboErase (HMR)核糖体RNA去除试剂盒即可轻松解决!

 
 
 
 
 
 

RNA酶H法的原理:rRNA及globin RNA与特异互补的DNA寡核苷酸链杂交,接着与DNA链杂交的RNA品种被RNA酶H特异消化去除,引入的DNA链则通过后续的DNA酶消化而去除。

 

 

 

1

产品应用

1

同时去除细胞质5S、5.8S、18S及28S 核糖体RNA,线粒体12S及16S 核糖体RNA, 以及珠蛋白globin mRNA

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适合物种:人、小鼠、大鼠

3

可用于检测带polyA尾的RNA(成熟mRNA)及不带polyA尾的RNA(包括非编码RNA及前体RNA

4

高质量与低质量RNA样本同样适用

 

 

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优异表现

1

稳定去除99.9% rRNA及99.9% globin mRNA

2

低至25ng的血液来源RNA样本也可获得丰富转录本信息

3

一天内快速完成RNA富集及建库流程(~6.5小时)(配套KAPA RNA Hyper建库试剂盒)

4

降低非特异性去除比例(与非酶去除法比较)

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KAPA更高效、重复性更好

▲ 图一 KAPA 实验流程与I品牌同类产品相比,KAPA对globin mRNA及rRNA的去除效率更高,重复性更好。测序文库从25/100/1000ng人血来源的RNA样本制备,实验流程采用了相应产品推荐的实验方案。

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KAPA助您发现更多

▲ 图二  KAPA 实验流程提升了*转录本的检测数量

 
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