新一代测序工作流程包括三个基本步骤:文库制备、测序和数据分析。了解每一步骤的基本知识以及如何规划您的NGS工作流程。
NGS工作流程的准备工作
大多数NGS工作流程都需要在提取后进行QC步骤。我们推荐使用紫外分光光度法来评估纯度,使用荧光分析法进行核酸定量。
NGS工作流程的第1步:文库制备
为了节省资源,可以将多个文库混合在一起,在同一运行中进行测序——该过程称为多重分析。接头连接过程中,标签序列(或说“条形码”)会添加到每个文库。这些条形码可以在数据分析过程中区分文库。
NGS工作流程的第2步:测序
在边合成边测序(SBS)过程中,化学修饰的核苷酸会通过天然的互补性与DNA模板链结合。每个核苷酸都有一个荧光标记和一个可逆终止子,后者可以阻止下一个碱基的掺入。荧光信号可以指示出加入的核苷酸种类,终止子被切割后,下一个碱基才可以继续结合。
NGS工作流程的第3步:数据分析
如今,您可以使用直观的数据分析应用程序来分析NGS数据,无需进行生物信息学培训或另外雇佣实验室人员。这些工具可以进行序列比对、变异检出、数据可视化或解读。