电泳槽是凝胶电泳系统的核心部分，其系统的迅猛发展主要也是体现在电泳槽上。根据电泳的原理，凝胶都是放在两个缓冲腔之间，电场通过凝胶连接两个缓冲腔。缓冲液和凝胶之间的接触可以是直接的液体接触，也可以间接通过凝胶条或滤纸条。管状凝胶电泳和垂直板状电泳大多采取直接液体接触方式。这种方式可以有效地使用电场，但在装置设计上有一些困难，如液体泄漏，电安全和操作麻烦等问题。水平板状电泳槽大多通过间接方式，用滤纸桥搭接以及最近使用缓冲液制作的凝胶条和滤纸条搭接，即半干技术，后种方式使装置简化，操作也大大方便。 电泳槽的使用：
1、将凝胶密封条框放在平板上，然后将凹型玻璃板与平板玻璃重叠。
2、将两块玻璃立起来使其底端接触桌面，用手将两块玻璃板夹住放入电泳槽内，然后插入斜楔板（直面对玻璃，斜面对槽）到适中程度，即可灌胶。
3、凝胶凝结后，轻轻取下梳子。
4、用手夹住两块玻璃板，上提斜楔板，使其松开，然后取下玻璃胶室去掉凝胶密封框，注意在上述过程中手始终给玻璃胶室一个压紧力，再将玻璃胶室凹面朝里置入电泳槽，插入斜楔板，将缓冲液加至内槽玻璃凹口以上，外槽缓冲液加到距玻璃上沿3mm处即可电泳，注意避免在胶室下端出现气泡。
5、加样时可用加样器斜靠在提手边缘的凹槽内，以准确定位加样位置。盖好上盖，在电压150伏以下进行电泳分离，根据指示剂位置确定电泳时间。电泳结束后，关掉电源按住本体提手打开上盖，拔掉固定板，取出玻璃板，用刀片或薄板轻轻将玻璃夹层分开。本电泳槽同时可进行双板电泳，如果只跑一块胶时，需要在另外一侧用单胶替代板代替玻璃。
注意事项：
1、电泳仪通电进入工作状态后，禁止人体接触电极、电泳物及其它可能带电部分，也不能到电泳槽内取放东西，如需要应先断电，以免触电。同时要求仪器必须有良好接地端，以防漏电。
2、仪器通电后，不要临时增加或拨除输出导线插头，以防短路现象发生，虽然仪器内部附设有保险丝，但短路现象仍有可能导致仪器损坏。
3、由于不同介质支持物的电阻值不同，电泳时所通过的电流量也不同，其泳动速度及泳至终点所需时间也不同，故不同介质支持物的电泳不要同时在同一电泳仪上进行。
4、在总电流不超过仪器额定电流时(zui大电流范围)，可以多槽关联使用，但要注意不能超载，否则容易影响仪器寿命。
5、某些特殊情况下需检查仪器电泳输入情况时，允许在稳压状态下空载开机，但在稳流状态下必须先接好负载再开机，否则电压表指针将大幅度跳动，容易造成不必要的人为机器损坏。
6、使用过程中发现异常现象，如较大噪音、放电或异常气味，须立即切断电源，进行检修，以免发生意外事故。
