测序试剂盒的捕获步骤通常指的是在基因组测序过程中,如何从样本中选择和富集特定的目标区域。捕获步骤通常与目标区域捕获(TargetedCapture)技术相结合,主要用于高通量测序(NGS)中,通过选择性地捕获特定DNA片段以提高分析的灵敏度和准确性。下面是捕获步骤的概述:
1.样本准备
首先,需要从样本中提取DNA。样本可以是血液、组织、唾液等,提取过程会根据不同的样本类型选择不同的提取方法。提取后的DNA会被质控,以确保其质量和完整性满足后续实验的要求。
2.DNA片段化
为了便于后续的捕获和测序,提取到的DNA需要经过片段化。这一步骤通过物理(例如超声波破碎)或酶切(如限制性内切酶)的方法将DNA分解成适合捕获的小片段。
3.目标区域设计与探针合成
根据研究的需要,选择目标区域(例如特定基因、外显子或其他感兴趣的序列)。然后,合成与这些目标序列互补的探针。探针通常是固定在微珠或其他固相支持物上的寡核苷酸序列。这些探针可以与样本中的目标DNA序列特异性结合。
4.目标区域富集(捕获)
在这一步,添加合成的探针与片段化的DNA进行杂交。探针与目标区域序列结合后,未结合的非目标DNA序列会被洗脱掉。这个过程可以通过反应体系中的条件控制,使目标DNA区域与探针特异性结合。
5.洗脱
捕获了目标序列后,使用洗涤步骤去除非特异性结合的杂散DNA。通过一定的盐浓度和温度控制,确保只有目标DNA区域被保留下来,而其他无关序列被去除。
6.扩增(可选)
有时,为了提高捕获序列的量,捕获后的DNA片段会进行PCR扩增。这一步是为了增加目标区域的信号强度,以确保后续测序的灵敏度。
7.文库构建
捕获后的目标区域DNA可以直接用于文库构建。文库构建过程中,DNA片段的两端会连接适配器,以便后续的测序平台进行识别和扩增。
8.测序
文库构建完成后,将其加载到高通量测序平台(如Illumina、BGISEQ等)进行测序,获取高质量的序列数据。
总结
捕获步骤的关键在于目标区域的选择、探针设计以及洗脱过程,通过精确的操作,可以确保只富集出感兴趣的区域,从而提高测序的效率和准确性。